付璐, 姚克宇, 杨啸林, 朱彦. 三种主流现代解剖学本体关于器官表达对比分析研究*. 2022. biomedRxiv.202209.00009
三种主流现代解剖学本体关于器官表达对比分析研究*
通讯作者: 朱彦, zhuyan166@126.com
DOI:10.12201/bmr.202209.00009
Comparative Study on the Expression of Organ among Three Mainstream Anatomical Ontologies
Corresponding author: Zhu Yan, zhuyan166@126.com
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摘要:人体解剖学知识作为生物医学知识的重要组成部分,其规范化和形式化的表示,为生理、病理、疾病等微观宏观知识的表示奠定了基础。通过对比“医学系统命名法——临床术语标准(SCT)”“跨物种解剖本体(Uberon)”“解剖学基础模型本体(FMA)”3种主流的解剖学本体关于器官的设计模式、分类结构及映射关系等,分析3者在器官的分类方法、器官相关术语的映射、偏侧及双侧器官的表达方式等方面存在的异同,可为解剖学本体在其他领域本体的研究和构建提供一定的参考。
Abstract: Human anatomy knowledge is an important part of biomedical knowledge, and its standardized and formalized expression lays the foundation for the expression of microscopic and macroscopic knowledge such as physiology, pathology, and disease. By comparing the design patterns, classification and mapping (database cross reference) of three mainstream anatomical ontologies of SCT, Uberon and FMA on organs, analyzing their similarities and differences in organ classification, term mapping, expression of laterality and bilaterality, etc., to provide some reference for the research and construction of anatomical ontology in other fields.
Key words: SNOMED CT(SCT); Uberon; The Foundational Model of Anatomy ontology, FMA提交时间:2022-09-13
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图表
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序号 提交日期 编号 操作 1 2022-07-11 bmr.202209.00009V1
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