徐子茜, 林秉奖, 邱勰, 黄华, 许素玲, 陆凌怡. 多组学分析MZT2A在皮肤黑色素瘤中的作用. 2024. biomedRxiv.202412.00012
多组学分析MZT2A在皮肤黑色素瘤中的作用
通讯作者: 陆凌怡, lulingyi802@foxmail.com
DOI:10.12201/bmr.202412.00012
Exploring the role of MZT2A in skin cutaneous melanoma based on multiomics data
Corresponding author: lu lingyi, lulingyi802@foxmail.com
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摘要:目的 基于多组学数据挖掘来探究与评估有丝分裂纺锤体组织蛋白2A(mitotic spindle organizing protein 2A, MZT2A)与皮肤黑色素瘤(skin cutaneous melanoma, SKCM)的生存预后及免疫治疗反应之间的关联。方法:通过TCGA数据库、GTEx数据、HPA、SUMMER数据库,分析MZT2A在SKCM中的表达差异及生存预后。利用David2分析MZT2A生物学功能分析及相关富集通路。利用TIMER、TISCH、TISIDB、TCIA和TIDE数据库分析和比较高低MZT2A基因表达组间免疫浸润细胞情况、免疫治疗反应及免疫逃逸能力的差异。结果 MZT2A基因在多种癌症中表达升高,尤其在SKCM中表达显著升高。高表达MZT2A的SKCM患者总体生存率降低。MZT2A表达量与SKCM组织中的CD8+T细胞,CD4+T细胞,巨噬细胞,中性粒细胞和树突状细胞的浸润程度均呈负相关。此外,MZT2A表达量越高,SKCM对于免疫检查点抑制剂的治疗反应可能越差。结论 MTZ2A基因的高表达与SKCM的不良预后相关,有望成为SKCM的生存预测靶标。高表达MTZ2A的SKCM的患者对于免疫检查点抑制剂治疗反应较差,以上对于预测SKCM生存预后、指导免疫靶向治疗提供理论依据。
Abstract: Objective Based on multiomics data mining, we explored and evaluated the association between mitotic spindle organizing protein 2A (MZT2A) and survival prognosis and immunotherapy response of skin melanoma (SKCM). Methods The expression difference and survival prognosis of MZT2A in SKCM were analyzed by TCGA database, GTEX data, HPA, SUMMER database. The biological function of MZT2A and related enriched pathways were analyzed by David2. The differences of immune infiltrating cells, immune therapy response and immune escape ability between high- and low- MZT2A groups were analyzed and compared by using TIMER, TISCH, TISIDB, TCIA and TIDE databases..Results The expression of MZT2A gene is elevated in a variety of cancers, especially in SKCM. SKCM samples with high expression of MZT2A have a poor overall survival. The expression of MZT2A was negatively correlated with the infiltration of CD8+T cells, CD4+T cells, macrophages, neutrophils and dendritic cells in SKCM tissues. In addition, the higher the expression of MZT2A, the worse the therapeutic response of SKCM to immune checkpoint inhibitors.. Conclusion MZT2A is a novel survival prediction target of SKCM. SKCM patients with high expression of MZT2A have poor response to immune checkpoint inhibitor treatment, which provides a theoretical basis for predicting the survival prognosis o and guiding immune targeted therapy of SKCM.
Key words: skin cutaneous melanoma; mitotic spindle organizing protein 2A (MZT2A); prognosis; multiomics; immunotherapy提交时间:2024-12-03
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序号 提交日期 编号 操作 1 2024-09-18 bmr.202412.00012V1
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